Кафка Хибино живёт в мире, который страдает от постоянных нападений кайдзю. С юных лет он мечтал вступить в Силы Обороны и даже поклялся об этом подруге детства Мине Асиро, но судьба распорядилась иначе. Много лет спустя он работает в конторе по уборке останков кайдзю и знакомится с молодым Рэно

Райза - обыкновенная девушка, живущая на острове и мечтающая о приключениях. Одним летним днём они с друзьями садятся в старую лодку и отправляются на материк, где Райза впервые в жизни видит алхимию.